O Cronobacter é um bacilo Gram negativo pertencente à família Enterobacteriaceae, antes conhecido como o Enterobacter cloacae. No ano de 1980, após estudos aprofundados das cepas de E. sakazakii, a bactéria foi reclassificada dentro da família Enterobacteriaceae, como um novo gênero: o Cronobacter spp.
Estudos mais atuais apontam que a bactéria apresenta sete espécies: sakazakii, malonaticus, dublinensis, turicensis, muytjensii, universalis e condimenti.
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